More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2624 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2624  replicative DNA helicase  100 
 
 		 472 aa  969    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  44.24 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  45.03 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  43.44 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  45.24 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  46.05 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  43.95 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.27 
 
 		 462 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  42.56 
 
 		 441 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  41.24 
 
 		 481 aa  359  5e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  43.02 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  43.91 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  43.72 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  42.32 
 
 		 463 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  44.17 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  44.06 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  45.68 
 
 		 472 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  45.68 
 
 		 472 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  45.74 
 
 		 473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  43.68 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  42.3 
 
 		 472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 459 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  42.58 
 
 		 465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  44.92 
 
 		 469 aa  352  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  44.55 
 
 		 472 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  42.07 
 
 		 449 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  43.68 
 
 		 454 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  42.26 
 
 		 445 aa  350  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.3 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.3 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.3 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.3 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.3 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.3 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  42.3 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  42.07 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  43.4 
 
 		 468 aa  349  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  41.4 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  43.84 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  44.14 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  43.61 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  42.22 
 
 		 456 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  42.63 
 
 		 451 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  41.53 
 
 		 456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  40.09 
 
 		 456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  43.92 
 
 		 454 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 465 aa  342  5.999999999999999e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  40.32 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  41.22 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  41.52 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  43.38 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  40.09 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  42.92 
 
 		 462 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  41.89 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  41.89 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  41.89 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  42.92 
 
 		 462 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  41.89 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  42.63 
 
 		 450 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  42.6 
 
 		 464 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  43.06 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  42.76 
 
 		 460 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  42.6 
 
 		 464 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  42.76 
 
 		 460 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  39.4 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  42.53 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  40.69 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  42.82 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  42.53 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 464 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  43.71 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  42.02 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  39.7 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  42.63 
 
 		 463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  41.54 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  41.35 
 
 		 469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  43.64 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  42.02 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  42.24 
 
 		 464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  42.05 
 
 		 470 aa  336  5e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  41.71 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  39.2 
 
 		 481 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 473 aa  336  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  42.31 
 
 		 460 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  42.47 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  41.58 
 
 		 468 aa  335  9e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  41.57 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>