More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0687 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 160 aa  327  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  73.33 
 
 		 160 aa  236  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  69.68 
 
 		 159 aa  235  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  69.03 
 
 		 159 aa  233  6e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  69.03 
 
 		 159 aa  233  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  70.32 
 
 		 159 aa  229  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  69.93 
 
 		 159 aa  229  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  67.74 
 
 		 159 aa  229  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  69.66 
 
 		 160 aa  227  6e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  69.93 
 
 		 155 aa  224  3e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 144 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.24 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.33 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.63 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 145 aa  150  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.23 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.25 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 146 aa  147  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 		 145 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  47.92 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.25 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.28 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 146 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.37 
 
 		 137 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.59 
 
 		 184 aa  141  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 150 aa  140  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50.38 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.1 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  48.85 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 151 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2367  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.76 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0207637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1198  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>