More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1354 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 333 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  93.03 
 
 		 330 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  43.7 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.44 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  37.05 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 		 320 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  37.43 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  38.55 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  42.33 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  41.45 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 186 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  34.21 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 166 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 169 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  48.48 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  26.57 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 163 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 182 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 253 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  39.81 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  29.85 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  46.97 
 
 		 136 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  31.13 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.68 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 188 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 125 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 136 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 125 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 125 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 133 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 138 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  39 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  24.86 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  26.57 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  44.62 
 
 		 154 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  37.61 
 
 		 132 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 132 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 141 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>