More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0417 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  278  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  95.1 
 
 		 149 aa  267  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  48.12 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  48.09 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  53.64 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 		 144 aa  115  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  48.85 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  50 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  45.99 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  43.64 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  44.27 
 
 		 163 aa  98.6  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  46.85 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  49.25 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  42.64 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  40.88 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  41.22 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  37.6 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  36.36 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.36 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.36 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.36 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.36 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.36 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.65 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.65 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.65 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.65 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.65 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  34.65 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0285  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.742627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  36.22 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>