72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0199 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0199  peptidase M23B  100 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0227  peptidase M23B  81.71 
 
 		 256 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0890169  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1343  peptidase M23B  42.86 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4760  peptidase M23B  45.26 
 
 		 295 aa  138  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1186  Peptidase M23  41.63 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2350  hypothetical protein  38.34 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  40.71 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  34.38 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  43 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  36.28 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  43 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  34.96 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  37.5 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3437  Peptidase M23  41.03 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112257  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1880  Peptidase M23  35.66 
 
 		 441 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.551304  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  33.81 
 
 		 174 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  37.72 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  37.06 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  33.33 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  31.34 
 
 		 348 aa  49.7  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  36.52 
 
 		 288 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  33.33 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  35.64 
 
 		 348 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  33.02 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  32.39 
 
 		 454 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.74 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  35.96 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  33.02 
 
 		 178 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.88 
 
 		 554 aa  45.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  34.91 
 
 		 169 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  35 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1743  Peptidase M23  32.08 
 
 		 646 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  26.14 
 
 		 306 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  33 
 
 		 446 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  34.86 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  37.62 
 
 		 412 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  32.79 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  37 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.62 
 
 		 420 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  38.33 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  37.62 
 
 		 400 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  37.62 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  35.64 
 
 		 425 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  37.62 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  36 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  32.26 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  33.63 
 
 		 435 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  33.96 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  35 
 
 		 447 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  32.79 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  31.94 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  35.29 
 
 		 425 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  28.3 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34 
 
 		 468 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1916  peptidase M23  33.33 
 
 		 290 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.636111  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  33.67 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  36.11 
 
 		 499 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  33.02 
 
 		 398 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2125  peptidase M23B  38.33 
 
 		 284 aa  42.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.883354  normal  0.328475 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1987  peptidase  33.33 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  27.95 
 
 		 330 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  29.7 
 
 		 254 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  28.66 
 
 		 299 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  28.66 
 
 		 299 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  34 
 
 		 479 aa  42  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  31.3 
 
 		 489 aa  42  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.19 
 
 		 309 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  32.74 
 
 		 438 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  34.45 
 
 		 311 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.79 
 
 		 503 aa  41.6  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  31.07 
 
 		 311 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  30.14 
 
 		 380 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>