More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3528 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  100 
 
 		 518 aa  1072    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 831 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 345 aa  99  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 340 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 343 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 333 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  36.99 
 
 		 329 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  35.15 
 
 		 340 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 336 aa  90.1  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 		 330 aa  90.1  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 381 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  37.33 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  34.32 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  25.51 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  25.22 
 
 		 333 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  34.48 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  23.7 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  31.74 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  25.79 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 		 332 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  31.61 
 
 		 332 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 289 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  23.37 
 
 		 289 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  36.31 
 
 		 339 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  23.58 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  23.24 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  36.03 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  33.54 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 286 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.71 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.52 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 331 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  22.59 
 
 		 275 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  23.73 
 
 		 286 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  31.76 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  31.76 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  31.76 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  25 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  33.11 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  31.76 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  31.76 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  31.76 
 
 		 877 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  33.1 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.06 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  28.03 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  22.58 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  20.88 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  22.32 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  31.45 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.58 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 340 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  43.04 
 
 		 328 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.04 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  43.04 
 
 		 273 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>