More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9402 on replicon NC_013596
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 259 aa  517  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  46.61 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  33.07 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  28.74 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  26.25 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.69 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2284  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.51 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.63 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  23.9 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  27.35 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.52 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  27.35 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  27.35 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  25.85 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.85 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  25.85 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.87 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.85 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  50 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  25.94 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7034  putative transcriptional regulator, GntR family  28.73 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4236  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.15 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  25.1 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  24.41 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.59 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  45.33 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.42 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.7 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  24.02 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  25.5 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  24.02 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 496 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  24.02 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.94 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>