More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7527 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1044    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  59.18 
 
 
546 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  56.67 
 
 
550 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  54.17 
 
 
551 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  49.38 
 
 
563 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  50.09 
 
 
537 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  54.05 
 
 
551 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  41.04 
 
 
547 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  46.93 
 
 
563 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  42.1 
 
 
603 aa  323  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  41.02 
 
 
583 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  43.69 
 
 
561 aa  299  7e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  34.57 
 
 
659 aa  292  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  31.83 
 
 
642 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  31.83 
 
 
642 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
644 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 
662 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.87 
 
 
643 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.96 
 
 
690 aa  283  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
659 aa  282  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  33.71 
 
 
644 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  34.38 
 
 
640 aa  281  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
644 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 
658 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.64 
 
 
668 aa  281  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  33.76 
 
 
658 aa  281  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
658 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
658 aa  279  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 
644 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  33.95 
 
 
658 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  33.95 
 
 
640 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  30.73 
 
 
634 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  34.16 
 
 
636 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  33.89 
 
 
641 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  31.43 
 
 
630 aa  277  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  32.34 
 
 
636 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  31.51 
 
 
645 aa  277  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  31.14 
 
 
666 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  39.45 
 
 
564 aa  270  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.4 
 
 
709 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  32.77 
 
 
638 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  33.21 
 
 
672 aa  266  5.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  31.02 
 
 
634 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  32.65 
 
 
638 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  29.23 
 
 
541 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  33.09 
 
 
663 aa  264  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  33.09 
 
 
663 aa  263  6e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  29.41 
 
 
541 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  28.39 
 
 
536 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  37.95 
 
 
657 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  32.55 
 
 
685 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  36.31 
 
 
659 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  30.89 
 
 
635 aa  259  7e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  34.93 
 
 
659 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  33.02 
 
 
581 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  35.19 
 
 
564 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0909  ABC transporter related  45.79 
 
 
563 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.9 
 
 
549 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  29.58 
 
 
535 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  35.42 
 
 
569 aa  258  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0961  ABC transporter related  32.36 
 
 
641 aa  258  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.21 
 
 
639 aa  258  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34.59 
 
 
540 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.78 
 
 
645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  32.6 
 
 
575 aa  253  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  30.22 
 
 
540 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.49 
 
 
585 aa  253  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  29.79 
 
 
627 aa  252  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  33.71 
 
 
540 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02481  ABC transporter, ATP binding component  35.11 
 
 
574 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  36.52 
 
 
632 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  33.02 
 
 
649 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2154  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
562 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.329294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.35 
 
 
561 aa  250  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  30.51 
 
 
644 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4937  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
566 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.07 
 
 
649 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1455  ABC transporter ATP-binding protein  34.64 
 
 
572 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 
560 aa  249  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 
626 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.59 
 
 
557 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  34.2 
 
 
564 aa  249  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 
518 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  31.87 
 
 
518 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 
632 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
643 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  30.32 
 
 
639 aa  248  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 
514 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0373  ATPase  35.12 
 
 
583 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  34.64 
 
 
572 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  30.43 
 
 
643 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  33.52 
 
 
640 aa  247  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 
636 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 
514 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  31.06 
 
 
641 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  33.52 
 
 
626 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  38.4 
 
 
613 aa  246  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  31.67 
 
 
543 aa  246  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>