More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7438 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
744 aa  1399    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.93 
 
 
726 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.6 
 
 
786 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  37.87 
 
 
611 aa  154  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.38 
 
 
581 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  42.86 
 
 
439 aa  125  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  35.53 
 
 
383 aa  125  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
389 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  39.62 
 
 
407 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  37.55 
 
 
423 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
390 aa  114  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  42.21 
 
 
405 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
404 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  40.98 
 
 
381 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
418 aa  112  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
420 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  39.82 
 
 
396 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
393 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.11 
 
 
699 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  37.16 
 
 
400 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  34.89 
 
 
399 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  35.74 
 
 
386 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.77 
 
 
458 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.01 
 
 
391 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
376 aa  98.6  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  31.87 
 
 
376 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  31.87 
 
 
376 aa  97.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
369 aa  96.3  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
372 aa  95.1  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
376 aa  94  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  35.81 
 
 
385 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  32.93 
 
 
386 aa  92.8  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
376 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
404 aa  91.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  37.5 
 
 
364 aa  91.3  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
404 aa  90.5  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  30.65 
 
 
359 aa  90.5  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  31.49 
 
 
376 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.68 
 
 
351 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
399 aa  90.1  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  30.39 
 
 
376 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
359 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
363 aa  89  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
376 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
359 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  29.83 
 
 
376 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  30.94 
 
 
376 aa  88.6  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  29.83 
 
 
376 aa  88.6  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
388 aa  88.6  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
359 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
397 aa  87.4  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
359 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
359 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
434 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.57 
 
 
426 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.67 
 
 
369 aa  86.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
359 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.46 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  29.65 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.95 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  35.47 
 
 
437 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
310 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.77 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
372 aa  82  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  37.75 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  30.11 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  31.82 
 
 
666 aa  80.5  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
398 aa  80.5  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
398 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  37.04 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.020485 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
421 aa  77  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
368 aa  76.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.66 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  30.22 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  22.61 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  24.75 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  32.56 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
412 aa  70.5  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  30.74 
 
 
378 aa  69.7  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  34.02 
 
 
591 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  31.19 
 
 
572 aa  68.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.55 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
567 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  31.13 
 
 
462 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  32.34 
 
 
409 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
425 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
394 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  32.69 
 
 
413 aa  66.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  28.78 
 
 
578 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>