More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7117 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7117  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 		 580 aa  1108    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0187299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  45.45 
 
 		 667 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4650  male sterility domain protein  61.54 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  0.580556 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  22.64 
 
 		 618 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  24.22 
 
 		 618 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  24.11 
 
 		 618 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  24.11 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  24.32 
 
 		 618 aa  135  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  23.75 
 
 		 618 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  24.02 
 
 		 618 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  24.02 
 
 		 627 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  24.02 
 
 		 627 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4497  hypothetical protein  32.29 
 
 		 369 aa  127  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3235  mxaA domain protein  23.19 
 
 		 618 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00294865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3829  hypothetical protein  29.39 
 
 		 362 aa  117  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3842  hypothetical protein  27.96 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1929  hypothetical protein  28.65 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3032  hypothetical protein  27.71 
 
 		 354 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  28.41 
 
 		 359 aa  94.7  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  29.02 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  35.18 
 
 		 437 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 324 aa  72  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  28.57 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.05 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  32.03 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1873  putative UDP-glucose 4-epimerase  31.16 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 322 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  28.53 
 
 		 373 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  32.14 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  28.16 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  27.39 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 		 320 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  27.57 
 
 		 356 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.61 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  29.55 
 
 		 381 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 		 315 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  29.55 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  27.52 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  27.17 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  26.69 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.57 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  28.88 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  27.7 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  31.17 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  27.63 
 
 		 937 aa  57.4  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.25 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  29.03 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.82 
 
 		 321 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  30.82 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.82 
 
 		 321 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.82 
 
 		 321 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.82 
 
 		 321 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 		 321 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 		 330 aa  57  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  29.93 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  27.72 
 
 		 257 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  29.93 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 321 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  28.04 
 
 		 642 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 246 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  25.07 
 
 		 392 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  25 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.8 
 
 		 331 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 260 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 315 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 		 343 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 340 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 358 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 258 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 278 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  33.96 
 
 		 274 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 340 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>