More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6999 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  42.92 
 
 
2888 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  45 
 
 
1908 aa  1571    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  67.53 
 
 
1935 aa  2516    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  100 
 
 
1929 aa  3829    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2179  Beta-ketoacyl synthase  56.37 
 
 
1927 aa  1845    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0632435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  52.28 
 
 
1985 aa  1843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  69.26 
 
 
1923 aa  2576    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0598  beta-ketoacyl synthase  38.31 
 
 
1951 aa  969    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4083  Erythronolide synthase  54.22 
 
 
1934 aa  1818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.74 
 
 
1984 aa  1440    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8249  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  47.33 
 
 
1501 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00620759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  33.07 
 
 
1272 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  35.88 
 
 
2553 aa  406  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  35.07 
 
 
2503 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  30.97 
 
 
3008 aa  394  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.32 
 
 
2300 aa  392  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  33.97 
 
 
2298 aa  390  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  33.07 
 
 
2189 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  33.55 
 
 
2260 aa  379  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  32.17 
 
 
2327 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  34.93 
 
 
2560 aa  373  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  31.56 
 
 
2542 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.04 
 
 
2249 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  34.3 
 
 
2674 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.45 
 
 
2750 aa  365  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  32.93 
 
 
2477 aa  363  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  31.7 
 
 
2772 aa  363  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.44 
 
 
2414 aa  363  2e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  31.16 
 
 
3243 aa  362  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  33.26 
 
 
2443 aa  361  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  31.13 
 
 
2683 aa  359  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  31.27 
 
 
2764 aa  359  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  29.83 
 
 
1772 aa  358  3.9999999999999996e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  30.46 
 
 
2664 aa  358  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  31.61 
 
 
1764 aa  357  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  30.58 
 
 
3115 aa  357  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  30.45 
 
 
2619 aa  354  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  35.23 
 
 
2314 aa  353  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.31 
 
 
2661 aa  353  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  34.56 
 
 
2386 aa  352  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  30.05 
 
 
2531 aa  352  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  34.7 
 
 
2338 aa  350  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  30.03 
 
 
2640 aa  349  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  30.71 
 
 
2657 aa  348  7e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.54 
 
 
2704 aa  345  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  30.34 
 
 
2624 aa  344  8e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  30.22 
 
 
2703 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  31.92 
 
 
2448 aa  343  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  30.7 
 
 
2694 aa  340  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  30.16 
 
 
2642 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  34.11 
 
 
2266 aa  338  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  30.85 
 
 
2693 aa  337  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  34.57 
 
 
1845 aa  336  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  30.55 
 
 
2754 aa  336  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  35.45 
 
 
2628 aa  332  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  29.74 
 
 
2620 aa  332  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  31.15 
 
 
2771 aa  326  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.37 
 
 
1372 aa  316  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  27.57 
 
 
1087 aa  313  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.15 
 
 
3099 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  33.05 
 
 
2816 aa  309  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
1874 aa  307  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
2551 aa  303  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  30.9 
 
 
4478 aa  303  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  28.62 
 
 
1587 aa  300  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  33.52 
 
 
2682 aa  299  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  28.59 
 
 
1559 aa  295  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  30.94 
 
 
2477 aa  295  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  28.23 
 
 
1144 aa  295  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6235  beta-ketoacyl synthase  32.8 
 
 
1303 aa  295  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  32.33 
 
 
4080 aa  293  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.47 
 
 
1559 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  30.19 
 
 
3676 aa  293  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  29.71 
 
 
3693 aa  293  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  29.71 
 
 
3693 aa  293  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  29.6 
 
 
3702 aa  292  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.11 
 
 
1337 aa  291  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.8 
 
 
1656 aa  291  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  28.08 
 
 
1349 aa  291  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  30.96 
 
 
3427 aa  290  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  27.9 
 
 
1349 aa  289  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  27.27 
 
 
2551 aa  288  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  29.93 
 
 
3696 aa  288  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  31.42 
 
 
1631 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  26.59 
 
 
1354 aa  286  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  29.47 
 
 
3679 aa  286  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  29.55 
 
 
1646 aa  286  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  28.86 
 
 
1408 aa  285  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  32.29 
 
 
7279 aa  284  9e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  30.38 
 
 
1413 aa  284  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  31.99 
 
 
1470 aa  283  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  31.34 
 
 
1114 aa  282  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  30.22 
 
 
2498 aa  281  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.29 
 
 
1822 aa  281  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
3092 aa  280  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  30.83 
 
 
2066 aa  280  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  28.59 
 
 
2462 aa  280  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  31.66 
 
 
1488 aa  278  8e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  31.06 
 
 
4840 aa  277  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.59 
 
 
2136 aa  278  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>