102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5015 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  78.01 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  73.71 
 
 		 253 aa  311  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  71.49 
 
 		 268 aa  291  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  54.55 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  52.49 
 
 		 316 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  51.52 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  47.03 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  40.43 
 
 		 172 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  38.51 
 
 		 169 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  38.24 
 
 		 155 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  41.22 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  33.8 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  33.88 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0959  hypothetical protein  54.69 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.498536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  33.8 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  28.35 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  31.82 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  34.43 
 
 		 370 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  31.2 
 
 		 152 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 380 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  49.3 
 
 		 466 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  30.38 
 
 		 401 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 385 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 385 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  30.38 
 
 		 401 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 386 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 386 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 386 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 386 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  50 
 
 		 385 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 386 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  25.2 
 
 		 159 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  48.94 
 
 		 343 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  40.85 
 
 		 317 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  40.85 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  40.91 
 
 		 385 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  40.91 
 
 		 385 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  27.15 
 
 		 386 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  42.62 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  44.26 
 
 		 386 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  39.13 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  39.13 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  39.13 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  39.13 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  39.13 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  39.13 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  41.43 
 
 		 465 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 465 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 465 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 465 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 465 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 465 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 465 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  26.76 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  25.74 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1397  transcriptional regulator, TrmB  35.96 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000176396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  37.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  25.83 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4203  integrase  42.62 
 
 		 386 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0462  Integrase catalytic region  26.75 
 
 		 400 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  35 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1531  integrase catalytic subunit  48.39 
 
 		 399 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205612  normal  0.437676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>