More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4609 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4609  putative dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.58 
 
 
337 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  66.67 
 
 
343 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.350471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.46 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  31.99 
 
 
343 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.51 
 
 
333 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4454  alcohol dehydrogenase  37.09 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  31.99 
 
 
343 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
337 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
336 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
340 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.12 
 
 
323 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  31.08 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.95 
 
 
335 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.36 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2975  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.32 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0388433  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.6 
 
 
337 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  32.11 
 
 
343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  36.58 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  31.8 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  31.8 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  31.8 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  31.8 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.12 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  41.36 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  31.8 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  31.8 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.42 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0603  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  28.21 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000710686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.36 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  26.47 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.31 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.93 
 
 
352 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  29.88 
 
 
337 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.98 
 
 
336 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2531  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
341 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.94 
 
 
347 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0771  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
333 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.92 
 
 
319 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.4 
 
 
357 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  29.67 
 
 
340 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1707  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  28.22 
 
 
336 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.508276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  26.51 
 
 
345 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.57 
 
 
349 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5082  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.43 
 
 
333 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.206655  normal  0.31977 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.1 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.88 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  26.11 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0511  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.41 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.203373  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  27.06 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  29 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  28.06 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  31.37 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.66 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.64 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.55 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  28.41 
 
 
354 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.41 
 
 
354 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  28.41 
 
 
365 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  32.76 
 
 
337 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  28.16 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  27.72 
 
 
340 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.7 
 
 
336 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 
354 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 
362 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.57 
 
 
342 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0745  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  30.61 
 
 
360 aa  116  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  30.23 
 
 
345 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  27.46 
 
 
344 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  29.85 
 
 
363 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.41 
 
 
344 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.48 
 
 
337 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.88 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  30.56 
 
 
345 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  26.05 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.4 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.66 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  27.89 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.37 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  30.56 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  27.41 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3701  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.3 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  27.46 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35 
 
 
342 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  29.55 
 
 
363 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  36.79 
 
 
330 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
351 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  35 
 
 
343 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  37.19 
 
 
349 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  31.25 
 
 
345 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.54 
 
 
354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>