More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3150 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 537 aa  1108    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  39.93 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  40.08 
 
 		 552 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  39.73 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  40.87 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  40.83 
 
 		 543 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  39.92 
 
 		 543 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  39.09 
 
 		 543 aa  359  9e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 		 543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  40.17 
 
 		 541 aa  356  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  38.39 
 
 		 541 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  39.47 
 
 		 586 aa  343  5e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  38.35 
 
 		 543 aa  329  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  35.64 
 
 		 560 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  37.15 
 
 		 528 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  35.84 
 
 		 527 aa  313  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  36.42 
 
 		 522 aa  301  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  38.36 
 
 		 536 aa  300  4e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  34.61 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 		 547 aa  276  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 542 aa  273  6e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  33.6 
 
 		 585 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  33.71 
 
 		 546 aa  268  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  35.38 
 
 		 561 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  34.88 
 
 		 546 aa  265  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  32.46 
 
 		 541 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 543 aa  227  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  36.26 
 
 		 537 aa  223  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.01 
 
 		 544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.64 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 533 aa  145  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 536 aa  144  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.45 
 
 		 536 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.45 
 
 		 536 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 544 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.8 
 
 		 536 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.49 
 
 		 525 aa  141  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  27.34 
 
 		 544 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2890  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 529 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.98 
 
 		 536 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0132  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 529 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229364  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  26.16 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.36 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.61 
 
 		 536 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  26.03 
 
 		 530 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1481  ABC oligopeptide transporter, perplasmic substrate-binding protein OppA  27.76 
 
 		 529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.869658  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.61 
 
 		 536 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.51 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.64 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  26.96 
 
 		 545 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.69 
 
 		 525 aa  134  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 542 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 525 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 525 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 		 622 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.52 
 
 		 525 aa  128  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 561 aa  128  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 		 590 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5349  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.42 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.60385  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 545 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  28.04 
 
 		 552 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  28.04 
 
 		 552 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  25.95 
 
 		 555 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  25.8 
 
 		 558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.42 
 
 		 529 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 534 aa  120  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.65 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  26.65 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  26.86 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  26.65 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  26.65 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 		 539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 529 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  26.45 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.63 
 
 		 543 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.28 
 
 		 529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  25.9 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 534 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 526 aa  117  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 543 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0067  extracellular solute-binding protein family 5  23.76 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 		 556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.18 
 
 		 528 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  26.38 
 
 		 556 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.6 
 
 		 545 aa  115  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  25.41 
 
 		 554 aa  115  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 510 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  25.99 
 
 		 540 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 516 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>