More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2243 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  100 
 
 		 226 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  69.47 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  69.03 
 
 		 228 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  67.57 
 
 		 230 aa  295  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  62.83 
 
 		 237 aa  278  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.22 
 
 		 228 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  60.53 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  61.33 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  61.4 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  57.33 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  57.96 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.78 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.78 
 
 		 235 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.65 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  56.31 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  50.22 
 
 		 334 aa  225  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.22 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  46.64 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  45.74 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 222 aa  178  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  39.41 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  38.98 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.98 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.98 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  38.98 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  38.98 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  38.98 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  38.98 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  38.98 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 248 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  39.15 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  43.95 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 272 aa  167  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  38.84 
 
 		 256 aa  167  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  42.92 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  41.13 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  37.07 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  43.3 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  36.53 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001205  DNA-binding response regulator  40.26 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  43.3 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  36.07 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 225 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>