221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1710 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  80.73 
 
 
193 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  62.5 
 
 
191 aa  239  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  56.19 
 
 
198 aa  207  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  57.53 
 
 
198 aa  194  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  53.51 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  50.53 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  53.93 
 
 
205 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  48.69 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  46.84 
 
 
208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  48.65 
 
 
196 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  47.12 
 
 
202 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  48.65 
 
 
196 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  47.12 
 
 
204 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  47.12 
 
 
204 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  47.12 
 
 
204 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  51.81 
 
 
191 aa  154  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  46.07 
 
 
201 aa  153  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  45.03 
 
 
204 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  47.12 
 
 
187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  46.49 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  44.86 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  42.11 
 
 
190 aa  134  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  40.43 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  38.74 
 
 
225 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  40.21 
 
 
183 aa  118  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  38.38 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  104  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  32.12 
 
 
182 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  33.86 
 
 
189 aa  101  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  32.99 
 
 
187 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  37.3 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  31.96 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  30.21 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  31.44 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  31.28 
 
 
186 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  35.23 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  38.04 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  32.46 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  29.17 
 
 
184 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  33.52 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  34.1 
 
 
208 aa  85.5  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  32.12 
 
 
186 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  37.74 
 
 
189 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  36.14 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  37.27 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  32.8 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  35 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  37.01 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  29.67 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  30 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  31.61 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  32.75 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  34.91 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  33.12 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  31.55 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  33.12 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  34.78 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  29.19 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  31.25 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  31.25 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  32.37 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  30.64 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  31.79 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  33.54 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  29.73 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  32.72 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  32.96 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  31.21 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  34.44 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  32.95 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  33.13 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  35.33 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  27.75 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  31.9 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  31.14 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  31.02 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  30.23 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  33.54 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  29.38 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  31.85 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  32.12 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  31.18 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  32.2 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>