67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4954 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 170 aa  350  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  46.47 
 
 		 171 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  37.42 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  39.2 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  38.07 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  38.64 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  37.64 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  34.55 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  35.19 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  35.4 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  31.25 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  51.56 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  51.56 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  51.56 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  52.31 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  51.56 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  49.23 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  28.99 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  50 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  50 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  49.41 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  49.41 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  43.24 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  58.33 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  28.74 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  29.68 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  29.68 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  51.56 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  30.32 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  30.32 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  54.24 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  43.55 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  54.24 
 
 		 442 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  48.44 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  51.79 
 
 		 89 aa  62  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  52.73 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  52.54 
 
 		 293 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  44.59 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  50 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  42.67 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  42.05 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  28.29 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  40.58 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  33.94 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  37.21 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  39.73 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  42.11 
 
 		 92 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  53.33 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  34.52 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  56.41 
 
 		 47 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  39.44 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  40.91 
 
 		 198 aa  47.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  37.14 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  32.41 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  38.03 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  37.11 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  36.76 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  42 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  32.95 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  33.63 
 
 		 137 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  43.4 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  26.67 
 
 		 131 aa  40.8  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>