More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4761 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4761  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  816    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  72.39 
 
 		 417 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  72.39 
 
 		 417 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  72.39 
 
 		 417 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0137  major facilitator superfamily MFS_1  80.59 
 
 		 403 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  72.39 
 
 		 417 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  72.14 
 
 		 417 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  57.25 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  57.25 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  56.75 
 
 		 406 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  56.75 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  57 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  56.75 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  56.75 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1032  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  60.1 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1806  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  60.1 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1274  major facilitator family transporter  60.1 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0134  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  60.1 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1761  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  60.1 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1959  major facilitator family transporter  60.1 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1785  major facilitator superfamily transporter sialate:H(+) symporter  60.1 
 
 		 408 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2527  major facilitator family transporter  59.59 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.039546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  55.94 
 
 		 406 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  55.94 
 
 		 406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1698  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 407 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2187  major facilitator superfamily MFS_1  57.85 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0329536  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  57.02 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2559  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 407 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1653  major facilitator superfamily MFS_1  48.82 
 
 		 430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.389792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11931  sialic acid transport integral membrane protein nanT  44.84 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85334  Carboxylic acid transporter protein homolog  35.96 
 
 		 493 aa  266  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01360  carboxylic acid transport protein, putative  37.69 
 
 		 542 aa  255  9e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00179855  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06703  sugar transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05550)  35.58 
 
 		 495 aa  237  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06095  carboxylic acid transport protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09450)  34.73 
 
 		 514 aa  226  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749433  hitchhiker  0.00628385 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01350  lactate transporter, putative  38.03 
 
 		 547 aa  199  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19632  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30177  carboxylic acid transporter protein  35.57 
 
 		 520 aa  193  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0149724  normal  0.0565304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4405  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2527  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.730064  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0255  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.299198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  27.34 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  27.34 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  27.34 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  27.39 
 
 		 510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  27.39 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  27.39 
 
 		 510 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 491 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  27.91 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  27.91 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  27.69 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  24.72 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  26.38 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  24.94 
 
 		 496 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  24.94 
 
 		 496 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  27.59 
 
 		 429 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 429 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  24.72 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  24.72 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  24.72 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  24.72 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  24.72 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  24.72 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  25.17 
 
 		 496 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  24.94 
 
 		 496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  24.94 
 
 		 496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  24.21 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  24.94 
 
 		 496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  24.72 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0452  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>