124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4570 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  100 
 
 		 419 aa  834    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  62.93 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  62.04 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  63.59 
 
 		 414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  60.19 
 
 		 412 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  49.75 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  46.84 
 
 		 400 aa  355  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  44.66 
 
 		 406 aa  336  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  43.72 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  45.5 
 
 		 405 aa  323  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  44.47 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  43.58 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  41.79 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  41.44 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  37.53 
 
 		 438 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  37.53 
 
 		 438 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  37.53 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  37.53 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  37.53 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  37.98 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  38.22 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  38.22 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  38.22 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  38.66 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  38.22 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  38.22 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  38.22 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  38.22 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  37.98 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  38.66 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  36.63 
 
 		 414 aa  235  9e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  37.32 
 
 		 411 aa  221  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  34.7 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  33.5 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  31.65 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  31.65 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  30.53 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  31.06 
 
 		 458 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  30.62 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  30.14 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  30.32 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  30.32 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  30.32 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  30.32 
 
 		 418 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  31.64 
 
 		 418 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  31.46 
 
 		 418 aa  176  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  32.69 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  32.69 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  32.69 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  32.69 
 
 		 418 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  32.69 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  29.9 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  29.67 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  29.67 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  29.67 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  29.67 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  29.67 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  29.67 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  29.67 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  29.43 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  32.88 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  31.66 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  28.3 
 
 		 459 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  22.99 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  23.43 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  23.94 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  21.88 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.37 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.97 
 
 		 379 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.47 
 
 		 383 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  24.34 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  20.45 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  21.58 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  19.62 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  19.39 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  20.45 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  26.14 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  26.14 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  26.14 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  20.3 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.14 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.14 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.14 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  26.14 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>