More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3970 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3970  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  822    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3157  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0967  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  30.12 
 
 		 420 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 420 aa  166  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  29.64 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  29.69 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  29.4 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2240  putative permease  31.42 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  26.07 
 
 		 447 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  23.82 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  25.23 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 433 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  25 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  25 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.5 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  26.97 
 
 		 447 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.77 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  24.61 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  26 
 
 		 436 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 430 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  26 
 
 		 436 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  26 
 
 		 436 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 460 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  24.83 
 
 		 430 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  24.83 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  24.31 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 454 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  25.81 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  25.81 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 436 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  23.57 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.21 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 460 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 409 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  24.37 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  24.37 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  26.14 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  26.14 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  24.37 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  24.91 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  24.37 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  24.37 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  23.81 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  24.37 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  23.84 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  25 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  23.83 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  25.9 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  23.57 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  23.05 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  24.25 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  24.14 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>