227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1391 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
307 aa  631  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  43.05 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
322 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
340 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  41.45 
 
 
301 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
309 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.47 
 
 
349 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  43.52 
 
 
312 aa  228  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
347 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
349 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
340 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 
326 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  40.21 
 
 
283 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
347 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
334 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
313 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
352 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
167 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  47.8 
 
 
177 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  49.06 
 
 
167 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  48.43 
 
 
167 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  47.8 
 
 
167 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  47.8 
 
 
167 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 
167 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  46.84 
 
 
167 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  46.84 
 
 
167 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  49.06 
 
 
167 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  49.06 
 
 
167 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  49.06 
 
 
167 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  49.06 
 
 
167 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  48.43 
 
 
167 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
173 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  47.83 
 
 
172 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  44.71 
 
 
170 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  49.06 
 
 
167 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  46.84 
 
 
167 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  46.84 
 
 
167 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  46.84 
 
 
167 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  46.2 
 
 
167 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  46.2 
 
 
167 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  46.2 
 
 
167 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
161 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  36.48 
 
 
163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  33.76 
 
 
161 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  37.27 
 
 
162 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  36.02 
 
 
160 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  25.85 
 
 
319 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  26.57 
 
 
319 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  37.97 
 
 
161 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  36.02 
 
 
157 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  38.71 
 
 
164 aa  97.1  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
321 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  28.33 
 
 
313 aa  86.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
161 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  34.27 
 
 
164 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  29.18 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  23.39 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.52 
 
 
325 aa  79  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.86 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.19 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.3 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.96 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.43 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.98 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  27.71 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.1 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.98 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.96 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  24.91 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.32 
 
 
312 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.41 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
345 aa  62.8  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
154 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 
160 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>