211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6275 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  100 
 
 
476 aa  975    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  33.27 
 
 
504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  35.31 
 
 
504 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  33.05 
 
 
486 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  34.91 
 
 
518 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  34.57 
 
 
505 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  33.12 
 
 
515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  32.9 
 
 
499 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  34.79 
 
 
499 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  36.54 
 
 
525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  33.04 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  32.75 
 
 
508 aa  239  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  32.77 
 
 
506 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 
555 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  35.41 
 
 
515 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  32.48 
 
 
523 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  31.4 
 
 
750 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  34.69 
 
 
500 aa  223  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  33.75 
 
 
542 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  31.07 
 
 
521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  33.76 
 
 
527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  33.61 
 
 
511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  33.61 
 
 
511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  33.61 
 
 
511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  31.41 
 
 
537 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  32.33 
 
 
541 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  33.48 
 
 
508 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  34.23 
 
 
495 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  33.83 
 
 
495 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  31.09 
 
 
525 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  32.4 
 
 
493 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  34.13 
 
 
522 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  30.24 
 
 
544 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  31.13 
 
 
524 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  32.58 
 
 
475 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  31.31 
 
 
540 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  33.2 
 
 
520 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  30.81 
 
 
546 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  32.22 
 
 
516 aa  203  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  33.26 
 
 
542 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  31.39 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  32.06 
 
 
538 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  30.6 
 
 
522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  32.31 
 
 
551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  32.25 
 
 
542 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  32.77 
 
 
564 aa  200  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  31.66 
 
 
507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  32.32 
 
 
485 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  31.13 
 
 
518 aa  196  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  30.54 
 
 
515 aa  196  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  32.02 
 
 
535 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  32.75 
 
 
518 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  31.22 
 
 
521 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  32.75 
 
 
459 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  31.6 
 
 
530 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  30.61 
 
 
571 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  31.28 
 
 
551 aa  180  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  31.89 
 
 
557 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  28.9 
 
 
545 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  28.78 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  31.24 
 
 
533 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  31.24 
 
 
508 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  31.24 
 
 
508 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
505 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  30.34 
 
 
490 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  30.13 
 
 
520 aa  166  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  29.49 
 
 
535 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  28.43 
 
 
532 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  30.57 
 
 
505 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  37.23 
 
 
643 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  27.77 
 
 
532 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  30.06 
 
 
527 aa  153  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  31.34 
 
 
547 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  28.18 
 
 
556 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  36.15 
 
 
300 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  29.17 
 
 
504 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.42 
 
 
505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  29.82 
 
 
520 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.99 
 
 
536 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  28.06 
 
 
539 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  29.92 
 
 
559 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  30.02 
 
 
484 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  28.44 
 
 
517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  25.55 
 
 
597 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  38.03 
 
 
505 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  32.7 
 
 
597 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  26.85 
 
 
613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.36 
 
 
546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  26.55 
 
 
539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  28.01 
 
 
522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  26.16 
 
 
539 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  28.34 
 
 
521 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.35 
 
 
519 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 
486 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  24.56 
 
 
507 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  25.5 
 
 
535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 
525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  26.12 
 
 
535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  24.72 
 
 
480 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  26.54 
 
 
524 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>