More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4883 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4883  ABC transporter related protein  100 
 
 		 546 aa  1084    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  59.18 
 
 		 536 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4107  ABC transporter related protein  56.32 
 
 		 550 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0611048  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4837  ABC transporter related protein  55.02 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  45.6 
 
 		 563 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  41.67 
 
 		 537 aa  362  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3350  ABC transporter related  38.01 
 
 		 547 aa  359  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1283  ABC transporter related  48.04 
 
 		 551 aa  332  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0227702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2588  ABC transporter related protein  40.14 
 
 		 563 aa  300  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.338473  hitchhiker  0.00775397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  34.47 
 
 		 640 aa  279  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  33.84 
 
 		 636 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.64 
 
 		 690 aa  268  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.84 
 
 		 645 aa  267  5e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.97 
 
 		 709 aa  266  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  32.06 
 
 		 634 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  31.25 
 
 		 634 aa  259  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  34.19 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  30.23 
 
 		 642 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  30.23 
 
 		 642 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.98 
 
 		 668 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  30.11 
 
 		 643 aa  258  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  31.89 
 
 		 644 aa  256  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  30.1 
 
 		 666 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 		 644 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4067  ABC transporter related  36.5 
 
 		 603 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  32.47 
 
 		 641 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.48 
 
 		 632 aa  253  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  33.15 
 
 		 659 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.79 
 
 		 549 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 662 aa  248  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  33.4 
 
 		 545 aa  248  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  33.09 
 
 		 659 aa  247  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 644 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  31.3 
 
 		 630 aa  246  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 659 aa  246  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.02 
 
 		 658 aa  246  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 658 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  32.08 
 
 		 649 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 644 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  30.89 
 
 		 658 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  30.89 
 
 		 658 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  30.89 
 
 		 658 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  35.44 
 
 		 657 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2931  ABC transporter related  36.68 
 
 		 561 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604145 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  31.35 
 
 		 640 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  33.09 
 
 		 645 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.83 
 
 		 636 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 		 557 aa  239  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  34.33 
 
 		 659 aa  239  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25310  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.9 
 
 		 585 aa  239  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00340355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.79 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  30.62 
 
 		 638 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  29.1 
 
 		 541 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.4 
 
 		 557 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  31.09 
 
 		 581 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.91 
 
 		 558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  28.93 
 
 		 643 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 		 536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  29.76 
 
 		 672 aa  235  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  32.95 
 
 		 540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  29.21 
 
 		 643 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  32.59 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  32.88 
 
 		 767 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  33.58 
 
 		 632 aa  233  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35.32 
 
 		 564 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0255265  normal  0.0613855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.69 
 
 		 559 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0405  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 658 aa  232  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  31.74 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.59 
 
 		 558 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  31.64 
 
 		 514 aa  232  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.64 
 
 		 595 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  34.39 
 
 		 631 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2686  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.79 
 
 		 559 aa  231  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  29.7 
 
 		 627 aa  231  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  32.7 
 
 		 626 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 		 555 aa  230  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  33.21 
 
 		 649 aa  230  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 		 560 aa  230  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  28.57 
 
 		 541 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  33.21 
 
 		 629 aa  230  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.9 
 
 		 561 aa  229  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  31.8 
 
 		 649 aa  229  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 560 aa  229  9e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.8 
 
 		 561 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  28.65 
 
 		 643 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  30.28 
 
 		 510 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  33.39 
 
 		 645 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.7 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  34.22 
 
 		 634 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  32.32 
 
 		 540 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  30.44 
 
 		 643 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  28.42 
 
 		 540 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 		 561 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  28.63 
 
 		 513 aa  227  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  28.95 
 
 		 641 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.57 
 
 		 561 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  31.8 
 
 		 540 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.89 
 
 		 639 aa  226  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  30.26 
 
 		 643 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>