More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3771 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  65.82 
 
 
280 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  66.42 
 
 
334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  63.99 
 
 
302 aa  361  7.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  64.34 
 
 
307 aa  360  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  68.6 
 
 
293 aa  358  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  68.36 
 
 
283 aa  358  8e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  67.84 
 
 
333 aa  351  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  67.3 
 
 
275 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  67.3 
 
 
275 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  67.97 
 
 
275 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  66.15 
 
 
261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  64.06 
 
 
271 aa  335  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  65.74 
 
 
276 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  64.26 
 
 
258 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  57.65 
 
 
277 aa  286  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  57.37 
 
 
271 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  56.8 
 
 
264 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  57.89 
 
 
258 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  57.89 
 
 
258 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  57.89 
 
 
258 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.89 
 
 
258 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
256 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  57.89 
 
 
258 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  57.36 
 
 
273 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  56.97 
 
 
336 aa  278  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  55.43 
 
 
255 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  53.75 
 
 
255 aa  278  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  55.6 
 
 
265 aa  278  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  58.87 
 
 
258 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  58.87 
 
 
258 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  54 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  56.68 
 
 
258 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  54 
 
 
257 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.06 
 
 
257 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  53.03 
 
 
265 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  53.03 
 
 
265 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  54.62 
 
 
255 aa  271  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
257 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
254 aa  270  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
257 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  59.11 
 
 
257 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.7 
 
 
257 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
257 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  56.68 
 
 
258 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
257 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.11 
 
 
257 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  52.57 
 
 
263 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  53.2 
 
 
257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  55.24 
 
 
256 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  56.28 
 
 
271 aa  269  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  52.78 
 
 
256 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  57.89 
 
 
257 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  57.89 
 
 
258 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  57.89 
 
 
258 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  54.44 
 
 
257 aa  268  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  54.58 
 
 
259 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  54.15 
 
 
270 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  53.1 
 
 
261 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  56.45 
 
 
258 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  53.41 
 
 
254 aa  267  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  55.06 
 
 
268 aa  266  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  54.84 
 
 
255 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  56.45 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  53.2 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  54.44 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  53.75 
 
 
259 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  52.76 
 
 
255 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  54.84 
 
 
258 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  54.3 
 
 
262 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  56.45 
 
 
253 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  54.4 
 
 
259 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  55.78 
 
 
270 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  53.97 
 
 
261 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  50 
 
 
255 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  55.42 
 
 
270 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  52.19 
 
 
288 aa  263  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  53.23 
 
 
255 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
258 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  55.42 
 
 
270 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  52.76 
 
 
260 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  52.76 
 
 
260 aa  262  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  55.38 
 
 
271 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  52.76 
 
 
260 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  53.57 
 
 
256 aa  262  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  57.03 
 
 
257 aa  261  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  52.8 
 
 
256 aa  261  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  53.33 
 
 
270 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  55.87 
 
 
257 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50 
 
 
286 aa  261  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  53.36 
 
 
255 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  56.28 
 
 
257 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  56.8 
 
 
260 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  49.64 
 
 
284 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  54.8 
 
 
648 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  53.01 
 
 
259 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  55.42 
 
 
264 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  51.18 
 
 
255 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  50.6 
 
 
256 aa  258  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  52.78 
 
 
256 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>