More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2379 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  83.72 
 
 		 398 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 396 aa  804    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  79.09 
 
 		 407 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  83.72 
 
 		 398 aa  669    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  77.89 
 
 		 406 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  76.13 
 
 		 404 aa  624  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  77.04 
 
 		 441 aa  625  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  76.01 
 
 		 398 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  77.72 
 
 		 399 aa  617  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  73.3 
 
 		 399 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  76.29 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  72.8 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  74.94 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  73.98 
 
 		 402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  73.28 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  72.08 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  72.7 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  69.23 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  71.57 
 
 		 405 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  68.54 
 
 		 414 aa  555  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  71.1 
 
 		 413 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  69.37 
 
 		 403 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  69.41 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  65.37 
 
 		 407 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  57.11 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  42.17 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.69 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.71 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  40.8 
 
 		 399 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.34 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.69 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  41.83 
 
 		 401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.94 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  41.48 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  40.9 
 
 		 398 aa  272  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.35 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.9 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.9 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.9 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  42.04 
 
 		 403 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.4 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.9 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.81 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  40.9 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  40.4 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.87 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.39 
 
 		 387 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.87 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.85 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.4 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.62 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.62 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  41.94 
 
 		 402 aa  264  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.87 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  40.09 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0147  acetyl-CoA acetyltransferase  43.19 
 
 		 379 aa  262  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.64 
 
 		 406 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.28 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  41.29 
 
 		 402 aa  262  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  41.3 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.87 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.65 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.1 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.35 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.15 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.49 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.61 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  40.62 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.4 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  40.62 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  40.05 
 
 		 401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.91 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.54 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.49 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.1 
 
 		 387 aa  259  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.49 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.49 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.49 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  42.46 
 
 		 390 aa  259  8e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.7 
 
 		 401 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.64 
 
 		 401 aa  258  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.21 
 
 		 401 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.7 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  36.48 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.36 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.7 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.7 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.81 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>