110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1432 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1432  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
96 aa  193  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.355549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0709  ArsR family transcriptional regulator  55.67 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366962  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2082  ArsR family transcriptional regulator  59.34 
 
 
99 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2306  ArsR family transcriptional regulator  63.1 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0311  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 
103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0946199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2083  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 
104 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043757  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0942  putative transcriptional regulator, ArsR family  57.78 
 
 
120 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8780  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 
111 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0547  transcriptional regulator ArsR family  52.13 
 
 
116 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4039  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2079  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
102 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.027067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2004  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3305  transcriptional regulator, ArsR family  42.71 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0350  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.92 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.401247  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2115  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
102 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1860  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.205916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1830  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1814  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2002  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2036  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.6853e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1865  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
102 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4762  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
112 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0331788  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2189  regulatory protein, ArsR  46.88 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00226868  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3804  regulatory protein, ArsR  47.92 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4195  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
118 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0522  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0714  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3914  ArsR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2404  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7389  transcriptional regulator  42.22 
 
 
103 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1550  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1253  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.278406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0370  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0318166  normal  0.038128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1280  ArsR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.775463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4394  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4138  ArsR family transcriptional regulator  49.44 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2717  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2093  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4325  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08020  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.769769  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05320  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01250  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3200  putative transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0289294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1060  transcriptional regulator, ArsR family  49.46 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0738542  normal  0.488039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3623  transcriptional regulator, ArsR family  44.33 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5430  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0491229  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22810  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.231302  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08070  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1715  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 
114 aa  67  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4661  regulatory protein ArsR  39.13 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  hitchhiker  0.00772902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7520  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.27 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4322  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.36 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247363  normal  0.980075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0310  transcriptional regulator, ArsR family  42.39 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0925537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0380  putative ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
115 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
103 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  40.86 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3018  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4728  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631655  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4814  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.393155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5113  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906955  normal  0.239964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21570  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5328  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8136  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.55 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0886361  normal  0.250619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0369  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0090  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.885774  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0293  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.850219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0337  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0718  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0805  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621414  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5770  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0401  regulatory protein, ArsR  28.4 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  27.27 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  29.58 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  40.3 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  31.17 
 
 
111 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3527  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 
134 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  36.11 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  34.57 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  32.53 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  35.21 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  32.93 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3520  ArsR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.360889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>