More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1375 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1375  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 458 aa  930    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 303 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6420  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.83075  normal  0.614202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 317 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 301 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5671  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.840206  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6818  transcriptional regulator, LysR family  34.16 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0724  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5408  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 307 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133517  normal  0.0100846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 301 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 307 aa  96.7  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1380  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 349 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0410906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  28.71 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 301 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 304 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  31.43 
 
 		 303 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.67 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7083  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 309 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.074768 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6995  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 309 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0324975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 312 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  31.43 
 
 		 303 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0265  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 301 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000402003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 312 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 302 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 309 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  27.96 
 
 		 323 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 305 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 292 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 306 aa  90.5  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  31.66 
 
 		 303 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 316 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 301 aa  90.5  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 323 aa  90.5  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 296 aa  90.1  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 304 aa  89.7  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01040  transcriptional regulator  26.01 
 
 		 301 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1324  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 293 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 301 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 296 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5149  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5074  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 307 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.507053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4460  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 291 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 300 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 297 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 294 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 306 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 303 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3996  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 291 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 298 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 298 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 308 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 300 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 293 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  30.2 
 
 		 304 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 319 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 296 aa  87  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 290 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 323 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 290 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 318 aa  86.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 290 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1508  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 307 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000734154  hitchhiker  0.000350474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  42.11 
 
 		 295 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  29.67 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.93 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 312 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  29.67 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 290 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  29.8 
 
 		 304 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  29.67 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 301 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 288 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  32.56 
 
 		 312 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1045  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 303 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  29.67 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 292 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 288 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  29.67 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4602  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 305 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 295 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 305 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0066  oxidative stress regulatory protein OxyR, putative  27.68 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  25.34 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  29.67 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 313 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>