93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0474 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  36.54 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  30.48 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  30.84 
 
 		 485 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  32.2 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  29.81 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  33.02 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  29.81 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  33.03 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  30.91 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0433  hypothetical protein  35.34 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0721991  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  32.08 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  31.43 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  25.23 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  31.43 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  31.43 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  30.48 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  30.48 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  30.48 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  30.1 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  31.48 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  31.48 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  30.48 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  28.16 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  29.09 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  28.04 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  28.16 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  27.18 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  32.99 
 
 		 307 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  27.62 
 
 		 190 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  26.21 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  25.89 
 
 		 243 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  29.81 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  28.97 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  25.71 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  25.25 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  27.62 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  33.04 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  28.44 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  37.23 
 
 		 277 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  35.11 
 
 		 277 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  29.36 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  28.97 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  37.7 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  27.73 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  28.97 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  25.41 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  25.41 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  24.77 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  29.81 
 
 		 258 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  26.53 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  26.52 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  25.41 
 
 		 261 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  31.33 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  42.31 
 
 		 211 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  29.9 
 
 		 279 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0617  photosynthetic reaction center, H-chain  36.62 
 
 		 257 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  27.82 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  26.67 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  33.8 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  32.76 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  37.25 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  28.43 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  33.33 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  24.27 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  24.24 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  30.33 
 
 		 261 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  29.52 
 
 		 526 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  23.23 
 
 		 158 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  27.62 
 
 		 130 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  33.93 
 
 		 169 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  24.51 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  24.76 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  26.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  26.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  24.51 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  24.51 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  34.92 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  35.59 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  37.29 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  29.67 
 
 		 259 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  34.29 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  32.18 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  34.29 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>