More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0154 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  49.77 
 
 
217 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  48.85 
 
 
220 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  50.24 
 
 
210 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  46.34 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  47.14 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  45.45 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  44.34 
 
 
217 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
209 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  45.41 
 
 
232 aa  151  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  46.63 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  43.81 
 
 
209 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.5 
 
 
203 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  44.32 
 
 
208 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
219 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  40.11 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  36.54 
 
 
400 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  38.83 
 
 
197 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.3 
 
 
200 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.64 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  34.16 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  44.83 
 
 
121 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  35.5 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.07 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  33.51 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  29.95 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  30.32 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  33.97 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  29.57 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  31.72 
 
 
307 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  32.78 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.08 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  31.67 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  40.19 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  40.19 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  40.19 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  40.19 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  40.19 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  40.19 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  33.09 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 
291 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.17 
 
 
260 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 
319 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  31.33 
 
 
196 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
273 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  37.25 
 
 
267 aa  62  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  28.06 
 
 
226 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  26.18 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  36 
 
 
275 aa  61.6  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
259 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
200 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  33.06 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.06 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  27.55 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  27.55 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
305 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.04 
 
 
390 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  28.06 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  34.78 
 
 
658 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.06 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  27.55 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  30 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.28 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  25.94 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  28.06 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  27.82 
 
 
255 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  32.05 
 
 
243 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  22.34 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
259 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  33.58 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  36.27 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  30.14 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
268 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>