More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0108 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  43.23 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  45.33 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  42.73 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  42.86 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  40.53 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  39.13 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 250 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  40.53 
 
 		 250 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  40.53 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  40.09 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  35.09 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  38.33 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  37.77 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  37.55 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  39.22 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  34.89 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  30.83 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.68 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl179  fru repressor  38.29 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0851  fructose operon transcriptional regulator  35.75 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151566  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  30.21 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0561  lactose transport regulator  33.19 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.324398  hitchhiker  0.00000158466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.74 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.74 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.74 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.74 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.17 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.74 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.74 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 274 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.74 
 
 		 269 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.52 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 252 aa  114  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  30.09 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  33.02 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  30.56 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3265  transcriptional regulator, DeoR family  30.08 
 
 		 277 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213162  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  30.42 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.03 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  29.11 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 254 aa  111  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 264 aa  111  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.55 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  31.13 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  31.22 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  32.55 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  33.49 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  29.66 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  28.38 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  28.7 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  32.88 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  30.18 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  30.84 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.78 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  28.96 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 288 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  30.47 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  29.36 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  31 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.91 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  28.88 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>