56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3216 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  73.08 
 
 		 234 aa  333  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  72.22 
 
 		 234 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  67.95 
 
 		 232 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  64.26 
 
 		 235 aa  301  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  60.54 
 
 		 231 aa  279  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  59.19 
 
 		 235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  59.19 
 
 		 231 aa  271  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.51 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  49.37 
 
 		 234 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  46.15 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.37 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.75 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.66 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.7 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.29 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.68 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  46.86 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.66 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.03 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.66 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.61 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.06 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.01 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.84 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.13 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  41.05 
 
 		 219 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.57 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.4 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.84 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.27 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  35.22 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.22 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  36.49 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.81 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.96 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.75 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.33 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.78 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.04 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.8 
 
 		 206 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.85 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  24.75 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  26.24 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  28.35 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  23.35 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  24.04 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.87 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.46 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.42 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.18 
 
 		 329 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  30.3 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  21.09 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.93 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.67 
 
 		 321 aa  42  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.58 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>