53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4936 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4936  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 362 aa  731    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0428435  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.71 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.433116  normal  0.249189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4604  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.41 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.472389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0472  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0889  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 		 415 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2902  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3948  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2975  chain length determinant family protein  25.82 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.782719  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0352  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0533175  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  23.58 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2891  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  23.1 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  23.1 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1653  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0595159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  23.23 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1400  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  24.65 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0764  lipopolysaccharide biosynthesis  23.58 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0283751  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1376  lipopolysaccharide biosynthesis  22.62 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648353  hitchhiker  0.00000667322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00688  hypothetical protein  24.63 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  23.45 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2132  chain length determinant protein  25.93 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1397  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2262  chain length determinant protein  23.25 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0523506  decreased coverage  0.000488654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2569  hypothetical protein  22.42 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028657  normal  0.698022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2770  hypothetical protein  23.88 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0579909  normal  0.616581 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2669  lipopolysaccharide biosynthesis  24.85 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3250  hypothetical protein  29.11 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  21.37 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.9 
 
 		 396 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  29.27 
 
 		 507 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.06 
 
 		 499 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.66 
 
 		 499 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  22.91 
 
 		 723 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  29.25 
 
 		 499 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  43.84 
 
 		 749 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  29.49 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2090  chain length determinant family protein  20.95 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.77217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 463 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  33.82 
 
 		 405 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  23.05 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  33.82 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  33.82 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  26.28 
 
 		 510 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  33.82 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1079  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.08 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  31.73 
 
 		 514 aa  42.7  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>