38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3915 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  100 
 
 		 1100 aa  2192    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  45.61 
 
 		 1933 aa  248  6e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  44.16 
 
 		 2807 aa  243  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  38.66 
 
 		 8871 aa  214  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  36.54 
 
 		 2198 aa  197  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  37.22 
 
 		 858 aa  192  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  39.28 
 
 		 901 aa  188  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  37.89 
 
 		 889 aa  188  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  36.46 
 
 		 665 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  34.91 
 
 		 2467 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  28.84 
 
 		 3563 aa  144  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  27.93 
 
 		 1991 aa  118  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1280 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  30.36 
 
 		 429 aa  105  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.62 
 
 		 1183 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0540  hypothetical protein  43.8 
 
 		 500 aa  91.3  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0525494  normal  0.138984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1176 aa  91.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  32.79 
 
 		 864 aa  89.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1027 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6418  hypothetical protein  25.24 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.47 
 
 		 1176 aa  72.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1394 aa  72.4  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  24.74 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1585 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3199  hypothetical protein  32 
 
 		 972 aa  67  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1136  hypothetical protein  24.94 
 
 		 433 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.063435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1068 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  40 
 
 		 2528 aa  62.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  25.28 
 
 		 569 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1121 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4872  hypothetical protein  25.71 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  34.55 
 
 		 833 aa  59.7  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  23.2 
 
 		 857 aa  55.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0937  hypothetical protein  22.22 
 
 		 356 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  28 
 
 		 1342 aa  48.9  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1588 aa  48.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  32.61 
 
 		 523 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3344  hypothetical protein  24.25 
 
 		 408 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.844152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>