More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0347 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 522 aa  1087    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  49.08 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  41.09 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  41.79 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  41.76 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  38.31 
 
 		 654 aa  346  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  41.79 
 
 		 583 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  39.53 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  39.92 
 
 		 545 aa  319  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  39.03 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  42.02 
 
 		 593 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  42.95 
 
 		 595 aa  316  8e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  39.24 
 
 		 575 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  39.41 
 
 		 588 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  35.19 
 
 		 549 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  33.72 
 
 		 551 aa  254  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  34.75 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  31.83 
 
 		 555 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  33.66 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  31.83 
 
 		 555 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  33.21 
 
 		 1088 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  32.48 
 
 		 1088 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  33.13 
 
 		 606 aa  236  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  34.72 
 
 		 454 aa  234  4.0000000000000004e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  31.6 
 
 		 591 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  47.39 
 
 		 258 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  31.8 
 
 		 601 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  35.28 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  30.89 
 
 		 1154 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  32.55 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  32.47 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  32.23 
 
 		 596 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  32.57 
 
 		 815 aa  228  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  32.68 
 
 		 574 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  31.46 
 
 		 1152 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  31.83 
 
 		 1095 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  33.9 
 
 		 532 aa  227  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  32.05 
 
 		 596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  32.05 
 
 		 596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  31.32 
 
 		 1100 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  31.5 
 
 		 535 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  32.09 
 
 		 572 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  30.73 
 
 		 1115 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  32.99 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  30.93 
 
 		 598 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  31 
 
 		 682 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  34.5 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  31.24 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  32.02 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  30.47 
 
 		 1154 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  31.65 
 
 		 601 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  31.6 
 
 		 1110 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  31.33 
 
 		 604 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  32.53 
 
 		 1092 aa  223  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  33.2 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  31.31 
 
 		 564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  33.66 
 
 		 1123 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  30.83 
 
 		 567 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  33.58 
 
 		 441 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  31.23 
 
 		 1114 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  31.37 
 
 		 1093 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  33.15 
 
 		 540 aa  220  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  31.02 
 
 		 1088 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  31.02 
 
 		 1088 aa  219  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  30.97 
 
 		 1109 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  31.58 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  31.85 
 
 		 1108 aa  219  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  32.87 
 
 		 1139 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  31.08 
 
 		 571 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  31.99 
 
 		 1085 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  31.27 
 
 		 1093 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  31.64 
 
 		 1102 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  30.32 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  31.08 
 
 		 1102 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  31.08 
 
 		 1102 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  30.82 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  31.88 
 
 		 1136 aa  217  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  30.84 
 
 		 1088 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  33 
 
 		 1130 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  31.07 
 
 		 1142 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  31.08 
 
 		 1121 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  35.07 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  33.33 
 
 		 572 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  32.02 
 
 		 574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  34.54 
 
 		 572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  31.34 
 
 		 557 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  29.4 
 
 		 1113 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  31.71 
 
 		 587 aa  213  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  30.24 
 
 		 1131 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  30.24 
 
 		 1131 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  30.24 
 
 		 1131 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  30.24 
 
 		 1131 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  30.24 
 
 		 1131 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  35.09 
 
 		 585 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  34.38 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  32.42 
 
 		 575 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  30.24 
 
 		 1131 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  30.37 
 
 		 1112 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  31.09 
 
 		 543 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>