228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  864    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  65.75 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  49.78 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  56.79 
 
 		 523 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  50.36 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  51.3 
 
 		 525 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  51.6 
 
 		 474 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  51.3 
 
 		 434 aa  359  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  51.18 
 
 		 493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  48.2 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  46.97 
 
 		 554 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  50.95 
 
 		 501 aa  344  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  50 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  43.84 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  47.46 
 
 		 459 aa  332  9e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  46.81 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  46.81 
 
 		 512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  47.37 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  51.44 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  45.86 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  45.63 
 
 		 531 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  44.47 
 
 		 456 aa  319  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  42.97 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  46.94 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  49.84 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  40.77 
 
 		 443 aa  293  3e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  41.38 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  42.74 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  39.66 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  50.83 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  49.66 
 
 		 398 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  40.72 
 
 		 545 aa  282  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  45.96 
 
 		 364 aa  282  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  47.13 
 
 		 374 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  41.37 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  45.67 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  46.25 
 
 		 361 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  36.79 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  44.03 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  41.24 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  41.25 
 
 		 467 aa  249  7e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  42.68 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  41.81 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  42.71 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  39.73 
 
 		 403 aa  240  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  37.2 
 
 		 504 aa  239  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  41.81 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  40.38 
 
 		 431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  31.71 
 
 		 531 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  33.11 
 
 		 532 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  31.45 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  30.38 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  29.97 
 
 		 548 aa  170  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  32.54 
 
 		 640 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  31.5 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  27.01 
 
 		 498 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  28.97 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  27.27 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  31.02 
 
 		 630 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  27.12 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  31.03 
 
 		 530 aa  156  6e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  32.61 
 
 		 527 aa  156  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  25 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  26.49 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  26.72 
 
 		 498 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1370  protein of unknown function DUF195  30.25 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  27.3 
 
 		 522 aa  153  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  26.74 
 
 		 518 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  26.74 
 
 		 519 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  26.74 
 
 		 519 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  28.04 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  28.04 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  26.74 
 
 		 518 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  27.03 
 
 		 537 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  25.87 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  27.2 
 
 		 507 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  27.73 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  30.75 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  26.73 
 
 		 535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  26.74 
 
 		 521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  26.74 
 
 		 521 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  29.86 
 
 		 518 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  26.74 
 
 		 521 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  30.11 
 
 		 501 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  29.86 
 
 		 520 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  29.1 
 
 		 476 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  28.37 
 
 		 495 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  28.32 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  29.63 
 
 		 513 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  28.7 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  29.1 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  29.1 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  29.1 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  27.79 
 
 		 518 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  29.1 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28.92 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  28.09 
 
 		 495 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  32.22 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  28.01 
 
 		 495 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>