118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 93 aa  187  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  73.91 
 
 		 93 aa  137  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  67.74 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  64.52 
 
 		 93 aa  120  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  60.22 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 92 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  58.06 
 
 		 93 aa  107  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 92 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 95 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  55.43 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 95 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  48.91 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  53.26 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  47.78 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.35 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  54.84 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  51.61 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 93 aa  91.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  47.83 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 		 93 aa  86.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  52.17 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 92 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  43.04 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  43.04 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.89 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  35.48 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  38.71 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  33.87 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3496  transcriptional regulator, AsnC family  31.67 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  33.85 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.58 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0316  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  32.76 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  32.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  32.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  32.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3937  transcriptional regulator, AsnC family  38.98 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  32.76 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  32.76 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  32.76 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  32.76 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2295  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.339671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0632  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1081  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1385  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.990948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 169 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2259  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2859  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1309  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4793  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5156  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.949798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3375  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3597  AsnC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.680866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 158 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5214  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4141  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3309  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0359106 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3752  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1235  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  28.33 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1442  AsnC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.572218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5098  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 191 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  29.23 
 
 		 169 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  28.79 
 
 		 173 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>