More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12070 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 276 aa  543  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  53.88 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  49.02 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4389  alpha/beta hydrolase fold  49.41 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  48.84 
 
 		 270 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  44.08 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0751  putative hydrolase  63.46 
 
 		 113 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.31973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.18 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30.7 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  30.99 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25.91 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  34.69 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  43.12 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  34.23 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  38.24 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  39.34 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  37.5 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  28 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  43.22 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  36.84 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  38.24 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.63 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  27.8 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  27.8 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  27.8 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  27.8 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  28.7 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 431 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0341  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  34.38 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  42.31 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  37.25 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5224  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164951  normal  0.667008 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  28.43 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.46 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  31.15 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1534  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  27.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  41.56 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  37.76 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  36.72 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>