234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  100 
 
 		 295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  54.51 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  51.12 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  49.45 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  45.9 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  44.81 
 
 		 281 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  48.63 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  44.94 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  47.73 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  44.56 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  44.57 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  44.03 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  42.52 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  43.82 
 
 		 279 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  45.74 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  47.01 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  43.49 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  42.49 
 
 		 279 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  42.49 
 
 		 279 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  41.57 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  41.95 
 
 		 270 aa  230  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  45.19 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  46.84 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  41.7 
 
 		 282 aa  225  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  44.49 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  44.17 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  44.17 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  45.15 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  43.23 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  46.64 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  45.52 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  41.05 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  43.45 
 
 		 284 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  42.92 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  43.1 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  43.1 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  47.94 
 
 		 270 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  48.45 
 
 		 274 aa  208  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  40.22 
 
 		 283 aa  201  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  40.85 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  40.85 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  41.2 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  41.88 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  41.2 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  39.03 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  38.38 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  39.11 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  35.77 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  38.38 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  36.47 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  37.5 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  36.72 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  36.52 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  33.68 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  32.26 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  33.21 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  33.82 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  32.84 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  32.1 
 
 		 271 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  30.56 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  31.37 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  32.59 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  32.31 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  32.47 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  31 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  31.37 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  31 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  31 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  31 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  31.54 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  30.9 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  31.02 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  31.9 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  29.96 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  29.96 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  31.77 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  29.96 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  29.55 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  28.78 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  28.78 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  29.21 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  29.21 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  32.75 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  34.87 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  31.01 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  29.07 
 
 		 286 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  29.58 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  29.18 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  31.14 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  28.42 
 
 		 267 aa  106  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  30.33 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  29.39 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  29.04 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  28.28 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  36.63 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  29.93 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  28.32 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  32.88 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>