39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0376 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0376  PepSY-associated TM helix  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3580  PepSY-associated TM helix  87.61 
 
 		 234 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3753  hypothetical protein  83.62 
 
 		 234 aa  410  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0289731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0345  PepSY-associated TM helix  49.78 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.965963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.57 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2276  hypothetical protein  37.79 
 
 		 247 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0509869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2335  hypothetical protein  38.43 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761845  normal  0.418419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2410  hypothetical protein  36.65 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0940252  normal  0.107205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3510  PepSY-associated TM helix  36.07 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0271  hypothetical protein  34.38 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0734  hypothetical protein  37.1 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.611753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0344  PepSY-associated TM helix  39.83 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.305287 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3439  PepSY-associated TM helix  36.02 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3633  PepSY-associated TM helix  35.55 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0854  PepSY-associated TM helix  36.02 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  34.96 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2356  hypothetical protein  33.04 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  31.67 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2460  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6865  hypothetical protein  30.96 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6817  hypothetical protein  29.36 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11713  hypothetical protein  29.17 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.33 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.38 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  29.38 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3511  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.38 
 
 		 258 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1052  hypothetical protein  30.7 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0735  hypothetical protein  27.04 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2334  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.01 
 
 		 658 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0217317  normal  0.528208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0270  hypothetical protein  24.66 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2409  PepSY-associated TM helix  26.13 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0289711  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2277  Na+-transporting NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NqrF  28.51 
 
 		 639 aa  72  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.712445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3754  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.55 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3581  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.11 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3464  ferredoxin  24.68 
 
 		 375 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  24.89 
 
 		 519 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  24.36 
 
 		 499 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0344  ferredoxin  24.89 
 
 		 378 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.253262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>