More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2322 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  93.45 
 
 
650 aa  1148    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  89.8 
 
 
637 aa  1096    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2438  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
632 aa  1288    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2025  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  93.76 
 
 
650 aa  1153    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1882  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  62.21 
 
 
565 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2096  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  62.38 
 
 
565 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.34 
 
 
560 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2322  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
632 aa  1288    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.756854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2444  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase, putative  59.35 
 
 
526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2014  phosphomethylpyrimidine kinase, thiamine-phosphate diphosphorylase  49.53 
 
 
557 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2382  phosphomethylpyrimidine kinase  50.16 
 
 
530 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2591  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 
535 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0347459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2200  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.88 
 
 
559 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1771  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.55 
 
 
613 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1859  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamine-phosphate diphosphorylase  48.11 
 
 
525 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
581 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.57 
 
 
513 aa  356  7.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0637429  normal  0.579661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0361  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.37 
 
 
500 aa  336  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  34.55 
 
 
488 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0254  phosphomethylpyrimidine kinase/thiamin-phosphate pyrophosphorylase  33.44 
 
 
529 aa  286  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  33.55 
 
 
488 aa  277  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  33.88 
 
 
526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1745  hydroxymethylpyrimidine kinase  31.32 
 
 
479 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.09 
 
 
479 aa  260  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00801461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1606  phosphomethylpyrimidine kinase / thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.83 
 
 
532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.41103  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47293  predicted protein  33.49 
 
 
580 aa  225  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2451  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.18 
 
 
440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4569  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.75 
 
 
211 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00615742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4373  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.75 
 
 
211 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4493  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.88 
 
 
211 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0244501 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.88 
 
 
211 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  hitchhiker  0.0000191197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3871  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
211 aa  208  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
211 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4441  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.88 
 
 
211 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235463 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4227  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.44 
 
 
211 aa  205  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.88 
 
 
211 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.262167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0215  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.45 
 
 
213 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4484  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.88 
 
 
211 aa  205  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0219  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.89 
 
 
213 aa  204  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03870  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.82 
 
 
211 aa  203  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4535  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.82 
 
 
211 aa  203  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03823  hypothetical protein  51.82 
 
 
211 aa  203  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4032  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.82 
 
 
211 aa  203  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0386  putative thiamin-phosphate pyrophosphorylase, ThiE  45.16 
 
 
367 aa  203  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4001  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.36 
 
 
211 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0346  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.38 
 
 
224 aa  200  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0454  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.38 
 
 
224 aa  200  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3854  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.38 
 
 
215 aa  199  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0283  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.79 
 
 
212 aa  197  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0206  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.39 
 
 
211 aa  197  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0267078 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00365  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.53 
 
 
471 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3716  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.43 
 
 
211 aa  194  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0463908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002073  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  44.94 
 
 
471 aa  193  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2984  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.98 
 
 
226 aa  192  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2434  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  30.83 
 
 
613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.527798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3572  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.75 
 
 
367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480222  hitchhiker  0.0000254394 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0892  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.51 
 
 
308 aa  181  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000295383  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0042  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.33 
 
 
214 aa  178  3e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3290  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.59 
 
 
307 aa  177  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2771  thiamine-phosphate diphosphorylase  45.02 
 
 
375 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207667  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3678  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2777  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3705  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1776  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3227  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2467  thiamine-phosphate diphosphorylase  44.8 
 
 
312 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3736  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
367 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0331  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.56 
 
 
374 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2727  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
216 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0340  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.11 
 
 
374 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.502306  normal  0.460006 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3005  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  43.26 
 
 
364 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0166  thiamine monophosphate synthase  33.42 
 
 
376 aa  165  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3071  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.2 
 
 
302 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.047455  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.59 
 
 
213 aa  163  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.564168  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0108  thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  41.6 
 
 
383 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244017  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1935  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.91 
 
 
612 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4311  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.16 
 
 
314 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.411869  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0209  thiamine-phosphate diphosphorylase  33.24 
 
 
378 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3322  thiamine monophosphate synthase  39.57 
 
 
384 aa  158  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.96 
 
 
215 aa  157  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0893  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.36 
 
 
244 aa  156  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.401641  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0208  thiamine monophosphate synthase  39.32 
 
 
349 aa  155  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.287057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0316  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.11 
 
 
371 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.416769  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3646  thiamine monophosphate synthase  39.21 
 
 
384 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3511  thiamine-phosphate diphosphorylase  44 
 
 
374 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155888  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2694  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.71 
 
 
375 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0413  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.71 
 
 
375 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.93 
 
 
309 aa  152  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.71 
 
 
375 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1939  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.93 
 
 
309 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.850438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.76 
 
 
309 aa  150  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  33.54 
 
 
265 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  32.91 
 
 
290 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  34.5 
 
 
518 aa  140  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  32.13 
 
 
265 aa  139  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  32.46 
 
 
279 aa  139  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  31.6 
 
 
257 aa  137  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  33.44 
 
 
264 aa  137  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  33.99 
 
 
260 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2163  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.85 
 
 
202 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507656  normal  0.244933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>