More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08900 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08900  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000429341  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2085  protein of unknown function DUF152  48.75 
 
 		 282 aa  232  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000113005  decreased coverage  0.0000000000000053007 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09450  hypothetical protein  43.07 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000208595  normal  0.0474468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0490  protein of unknown function DUF152  41.37 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000444061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  34.98 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  35.6 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  34.34 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  38.63 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  29.88 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  38.63 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  38.2 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  34.01 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  38.72 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  32.81 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.47 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  33.88 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  31.72 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  31.54 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  35.32 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  34.16 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  35.62 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  32.96 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  34.04 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  30.26 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  30.65 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1488  hypothetical protein  35.92 
 
 		 254 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  31.94 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  33.47 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  30.89 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  32.23 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  31.4 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  30.15 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  33.2 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  36.18 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  29.88 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  34.65 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  33.48 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  29.92 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.08 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  34.94 
 
 		 272 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  30.77 
 
 		 262 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  32.53 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  32.16 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  31.17 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  29.15 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  31.4 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  31.54 
 
 		 242 aa  99.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  32.42 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  30.59 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  31.17 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  28.85 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  34.75 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  34.75 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  27.31 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1855  hypothetical protein  32.26 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  33.06 
 
 		 248 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  32.67 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  30.2 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  28.63 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  33.76 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  34.54 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  34.69 
 
 		 255 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  34.19 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  34.27 
 
 		 240 aa  95.9  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  30.53 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  32.49 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  31.85 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  33.2 
 
 		 254 aa  95.5  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  28.92 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  31.47 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  32.5 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  29.13 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  30.74 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  32.79 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  32.91 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  27.91 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  30.64 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  33.19 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  33.2 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  31.3 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  30.96 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  30.4 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.32 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  29.6 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.6 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  33.19 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  34.12 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  34.12 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  32.33 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0713  hypothetical protein  27.23 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  33.91 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  34.04 
 
 		 243 aa  92.4  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  33.62 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  34.19 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  34.6 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  26.39 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  32.77 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  32.49 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>