More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3497 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
572 aa  1133    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
579 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
576 aa  339  8e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
544 aa  320  6e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
564 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 
551 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
554 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
732 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
692 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
692 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
569 aa  190  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.86 
 
 
587 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
728 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.93 
 
 
692 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  27.53 
 
 
700 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.64 
 
 
602 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.61 
 
 
545 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 
692 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  27.81 
 
 
692 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.06 
 
 
740 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
545 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.42 
 
 
600 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.36 
 
 
543 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.65 
 
 
569 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.13 
 
 
741 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.89 
 
 
551 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  25.22 
 
 
741 aa  171  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  25.04 
 
 
741 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.8 
 
 
742 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.35 
 
 
563 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 
758 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.26 
 
 
563 aa  167  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  27.43 
 
 
685 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.73 
 
 
743 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.41 
 
 
600 aa  156  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000236655 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.77 
 
 
547 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  26.54 
 
 
575 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.55 
 
 
600 aa  151  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
741 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.71 
 
 
606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.51 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.49 
 
 
585 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
593 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  26.54 
 
 
564 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.56 
 
 
585 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 
556 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  23.8 
 
 
585 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
564 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.58 
 
 
585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.57 
 
 
589 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
556 aa  135  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  24.44 
 
 
552 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  24.95 
 
 
583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  24.44 
 
 
583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  25.33 
 
 
556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 
738 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.81 
 
 
543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 
585 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  26.19 
 
 
589 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
615 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.41 
 
 
586 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 
556 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  24.44 
 
 
583 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 
603 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.23 
 
 
606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3589  putative ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 
634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  23.86 
 
 
545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 
603 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.569333  normal  0.0423776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.23 
 
 
590 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.45 
 
 
558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.18 
 
 
566 aa  127  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2938  putative transmembrane ABC transporter protein  26.58 
 
 
603 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.880644  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 
561 aa  126  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.23 
 
 
590 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  25.9 
 
 
589 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 
590 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  25.85 
 
 
590 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  26.09 
 
 
585 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.9 
 
 
589 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.37 
 
 
590 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  25.9 
 
 
589 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 
590 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.65 
 
 
541 aa  124  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 
590 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.13 
 
 
568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1612  ABC transporter permease  25.9 
 
 
556 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0620954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1787  putative ABC transporter, permease protein  25.9 
 
 
556 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1736  ABC transporter permease  25.9 
 
 
556 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
663 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1813  ABC transporter, permease protein, putative  26.18 
 
 
556 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.834992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1573  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  25.71 
 
 
556 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.62 
 
 
575 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.16 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.54 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.39 
 
 
568 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.655612  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  24.77 
 
 
539 aa  114  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.49 
 
 
609 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.18 
 
 
557 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>