112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3126 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  44.09 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  42.45 
 
 		 288 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  41.01 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  42.09 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  40.29 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  39.57 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.49 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.49 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.37 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  42.22 
 
 		 279 aa  169  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  38.64 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.08 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.08 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.89 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.65 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  40.51 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  40.51 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  38.72 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  38.81 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  39.55 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  38.43 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  38.43 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.43 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  36.79 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  39.85 
 
 		 294 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  36.43 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20670  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  39.33 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  39.03 
 
 		 267 aa  146  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.22 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.14 
 
 		 274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  37.83 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  37.83 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  37.83 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  37.83 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  37.83 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  37.83 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4902  hypothetical protein  38.58 
 
 		 251 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.32 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  32.01 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  29.1 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  29.52 
 
 		 235 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  27.56 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  29.58 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  29.58 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  29.58 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  30.39 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  29.58 
 
 		 252 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  29.23 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  28.47 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  31.65 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  34.18 
 
 		 235 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  32.91 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  27.02 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  96.3  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  31.33 
 
 		 246 aa  95.9  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  34.18 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  27.59 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  27.59 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  25.18 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  27.59 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  28.42 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  27.59 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  26.95 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  29.71 
 
 		 435 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  24.83 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  27.59 
 
 		 249 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  27.67 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  32.28 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  27.08 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  37.33 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  33.93 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  26.33 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  26.76 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  26.76 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  26.76 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  31.01 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  25.18 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  33.12 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  27.05 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  28.06 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  28.75 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  27.15 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  35.71 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  26.12 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  26.92 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  27.13 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  24.86 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  27.34 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  26.15 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  33.72 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  29.87 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  30.46 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  30.22 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>