131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1095 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  99.6 
 
 		 253 aa  528  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  67.86 
 
 		 257 aa  370  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  61.26 
 
 		 252 aa  322  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  59.92 
 
 		 252 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  59.92 
 
 		 252 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  59.92 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  59.92 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  59.52 
 
 		 252 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  60.47 
 
 		 252 aa  319  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  59.92 
 
 		 252 aa  318  7e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  60.87 
 
 		 249 aa  314  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  60.87 
 
 		 249 aa  314  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  60.08 
 
 		 249 aa  314  7e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  59.77 
 
 		 249 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  59.77 
 
 		 249 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  59.77 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  44.84 
 
 		 245 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  41.6 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  40.68 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  40.83 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  40.83 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  40.83 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  40.83 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  40.83 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  40.42 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  40.42 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  39.59 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  38.65 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  40.17 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  35.47 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  37.35 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  33.86 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  37.97 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  34.51 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  33.2 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  33.46 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  32.31 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.14 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  32.51 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  28.77 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  33.33 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.41 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  34.02 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  28.11 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  25.26 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  31.4 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  29.39 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  28.06 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  26.91 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  26.06 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  27.27 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  26.74 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  26.76 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  37.96 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.52 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.1 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  27.12 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.41 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  26.59 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.37 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.74 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  30.04 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.13 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  28.89 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.47 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  27.02 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2236  YdjC family protein  29.37 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.02 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4902  hypothetical protein  27.17 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515239  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2010  YdjC-like protein  29.32 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  27.01 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  27.76 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  27.41 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  27.41 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.07 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.41 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.3 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  28.72 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  27.74 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.9 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.66 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  31.61 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2324  YdjC family protein  28.74 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  30.07 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  26.32 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.51 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  23.29 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1338  YdjC family protein  28.11 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3769  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.937904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2187  YdjC family protein  29.17 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  30.38 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  29.41 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  29.41 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  27.78 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  26.45 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  29.41 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  29.41 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  29.41 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>