92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3150 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  100 
 
 		 272 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  29.08 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  28.06 
 
 		 289 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.08 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  27.43 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  28.51 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  30.86 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  24.07 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.59 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.08 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  30.34 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  28.48 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  28.24 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  24.62 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  26.69 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  27.63 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.86 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  35.77 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  25.74 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.41 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  33.58 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  29.1 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  29.69 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  26.89 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  29.15 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  34.59 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  34.59 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  34.59 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  31.62 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  34.31 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  34.31 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  30.67 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  34.31 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.34 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  33.83 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  30.29 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.08 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  33.83 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  30.53 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  34.59 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  33.83 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  34.31 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  33.08 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.24 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  28.57 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.02 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  26.53 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3769  hypothetical protein  30.07 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.937904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.15 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  27.41 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  28.24 
 
 		 293 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  28.34 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.34 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  26.19 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.32 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  27.78 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  38.57 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1066  YdjC family protein  32.31 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2351  YdjC family protein  35.35 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.85 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  40 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  24.52 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  27.13 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  26.91 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  40.96 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  39.76 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  27.7 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  26.98 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  32.39 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  38.55 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  32.39 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  32.39 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  32.39 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  32.39 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  32.39 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  32.39 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.09 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  40.58 
 
 		 301 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  36.23 
 
 		 291 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.33 
 
 		 274 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>