113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1768 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  100 
 
 
295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  96.27 
 
 
295 aa  517  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  96.61 
 
 
295 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  96.27 
 
 
295 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  96.27 
 
 
295 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  96.27 
 
 
295 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  94.92 
 
 
289 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  80.62 
 
 
294 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  81.91 
 
 
294 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  81.91 
 
 
294 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  81.91 
 
 
294 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  81.57 
 
 
294 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  80.97 
 
 
294 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  82.35 
 
 
294 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  69.63 
 
 
280 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  69.2 
 
 
265 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  70.59 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  67.16 
 
 
283 aa  335  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4902  hypothetical protein  73.39 
 
 
251 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  65.92 
 
 
275 aa  311  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20670  hypothetical protein  62.34 
 
 
235 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  53.38 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  53.38 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  45 
 
 
280 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  46.64 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  48.46 
 
 
279 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  49.82 
 
 
280 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  47.5 
 
 
291 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  48.06 
 
 
267 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  44.64 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  44.72 
 
 
280 aa  195  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  41.13 
 
 
288 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  37.28 
 
 
288 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.71 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.65 
 
 
278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  37.28 
 
 
288 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  37.89 
 
 
289 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  34.77 
 
 
288 aa  158  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.04 
 
 
288 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  34.67 
 
 
288 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  34.49 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  29.96 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  26.02 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  28.94 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  26.12 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  27.07 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  29.18 
 
 
435 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  34.69 
 
 
252 aa  89  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  28.26 
 
 
251 aa  85.9  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  31.28 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  30.63 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  26.64 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  32.58 
 
 
234 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  34.09 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  34.09 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  29 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  26.33 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  28.62 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  28.62 
 
 
252 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  34.09 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  34.09 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  25.88 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  26.33 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  26.33 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  28.62 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  28.62 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  34.09 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  34.09 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  34.09 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  34.09 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  28.25 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  34.56 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  27.15 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  25.7 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  23.31 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  29.45 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  29.68 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  29.68 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  29.68 
 
 
249 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  29.68 
 
 
249 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  29.68 
 
 
249 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  29.68 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  28.83 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  29.61 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  25.89 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  25.71 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  23.19 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  26.09 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  31.73 
 
 
224 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  32.12 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  30.36 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  23.7 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  30.38 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0597  hypothetical protein  29.84 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  30.12 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2236  YdjC family protein  31.23 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  27.33 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  22.5 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  29.48 
 
 
291 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>