122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0972 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  100 
 
 		 280 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  87.1 
 
 		 280 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  85.66 
 
 		 280 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  84.23 
 
 		 280 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  78.78 
 
 		 284 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  78.85 
 
 		 291 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  52.31 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  52.35 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  50.9 
 
 		 294 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  51.25 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  51.25 
 
 		 294 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  51.25 
 
 		 294 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  51.25 
 
 		 294 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  50.9 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  52.87 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  50.54 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  47.1 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  50.18 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  53.88 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  49.1 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  49.1 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  49.1 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  48.75 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  48.75 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  48.75 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4902  hypothetical protein  52.87 
 
 		 251 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515239  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  47.16 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  48.92 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20670  hypothetical protein  47.93 
 
 		 235 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  46.29 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  46.29 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  36.79 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.22 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  36.23 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  36.7 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.04 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  35.36 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  34.43 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  34.94 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.56 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  32.93 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  29.07 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  34.9 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  24.68 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  31.91 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  22.8 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  32.28 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  28.85 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  28.89 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  34.55 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  28.85 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  31.29 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  28.31 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  29.28 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  28.33 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  28.33 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  28.33 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  28.33 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  28.33 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  28.95 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  31.71 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  25.17 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  31.71 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  31.71 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  32.34 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  37.5 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  29.81 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  32.34 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  33.14 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  23.3 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  27.42 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  32.73 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  30.88 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  31.49 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  32.54 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  31.1 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  32.12 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  23.84 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  31.52 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  30.37 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0563  YdjC family protein  37.84 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  31.71 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  31.71 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  31.71 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  31.71 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  31.71 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  31.71 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  29.46 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  26 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  32.41 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  27.98 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  26 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  31.91 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2585  YdjC-like protein  33.33 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  28.24 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  28.15 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3638  YdjC family protein  37.67 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.962606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>