73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3997 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3997  YdjC family protein  100 
 
 		 331 aa  688    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  56.46 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  51.07 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  33.33 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  33.82 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  31.68 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1066  YdjC family protein  33.45 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  32.04 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  31.82 
 
 		 283 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  21.68 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  35.16 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  35.16 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  28.95 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  28.95 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  33.59 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  34.85 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  28.48 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  27.74 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  30 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  32.81 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  25.93 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  26.14 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1607  YdjC family protein  30.4 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.41 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  25.83 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.67 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  30 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  29.45 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.67 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  28.99 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.89 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  26.88 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.01 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.15 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  29.93 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  29.93 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  29.93 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  52.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  27.13 
 
 		 289 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  28.68 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.01 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  28.24 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  30.37 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  28.74 
 
 		 247 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  28.24 
 
 		 288 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  26.88 
 
 		 252 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  26.92 
 
 		 252 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  25 
 
 		 251 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  28.68 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  29.1 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  29.1 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  29.1 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  21.09 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  28.68 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  28.68 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  29.1 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  29.1 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  29.1 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  28.68 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  29.1 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  28.68 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  25.77 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  28.36 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  24.69 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  26.06 
 
 		 261 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  27.74 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.74 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>