124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1954 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  97.62 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  94.05 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  92.86 
 
 		 249 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  93.25 
 
 		 249 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  93.25 
 
 		 249 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  92.46 
 
 		 249 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  92.46 
 
 		 249 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  78.97 
 
 		 252 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  78.57 
 
 		 252 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  78.57 
 
 		 252 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  78.57 
 
 		 252 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  78.57 
 
 		 252 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  65.87 
 
 		 252 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  61.26 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  61.26 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  61.26 
 
 		 253 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  59.68 
 
 		 257 aa  311  9e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  41.43 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  38.33 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  38.33 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  38.33 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  38.33 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  37.92 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  37.92 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  38.08 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  33.33 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  37.45 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  37.04 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  37.4 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  37.5 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  39.57 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  34.18 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  30.28 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  33.99 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  29.88 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  30.68 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  27.02 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  27.71 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  32.58 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  28.33 
 
 		 307 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.12 
 
 		 288 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.73 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  30.92 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  26.28 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  27.02 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  31.14 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.33 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  28.67 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  33.13 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.25 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0374  YdjC family protein  35.66 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.106871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.74 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  31.85 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5304  YdjC family protein  27.01 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.693916  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2010  YdjC-like protein  29.2 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3190  YdjC-like protein  29.1 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  31.52 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1843  YdjC-like protein  28.63 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5902  YdjC family protein  28.8 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  31.71 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  27.47 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  27.47 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  27.47 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4120  YdjC-like protein  28.74 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  26.74 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  29.45 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4720  YdjC-like protein  29.51 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1647  YdjC family protein  29.52 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  24.01 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  31.87 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.91 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  28.83 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  27.11 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  25.19 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  28.83 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  28.83 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.13 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2568  YdjC-like protein  26.1 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  29.63 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  28.83 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  29.03 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  28.83 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  26.74 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1678  hypothetical protein  27.6 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  29.34 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  27.5 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1523  YdjC family protein  22.9 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  32.12 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  23.72 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0125  hypothetical protein  30.67 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0136  hypothetical protein  30.67 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2236  YdjC family protein  28.85 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3769  hypothetical protein  23.68 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.937904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  30.86 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2187  YdjC family protein  30.34 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2324  YdjC family protein  28.85 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1052  YdjC family protein  27.22 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>