124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2415 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2415  YdjC-like protein  100 
 
 
288 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000254444  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1151  hypothetical protein  81.94 
 
 
288 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2962  YdjC family protein  71.18 
 
 
288 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0879  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  67.71 
 
 
288 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3381  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  66.67 
 
 
288 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2826  YdjC family protein  61.46 
 
 
288 aa  362  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0850173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3091  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  59.72 
 
 
288 aa  340  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0037118  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  42.39 
 
 
278 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3126  YdjC family protein  42.09 
 
 
289 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246064  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0386  hypothetical protein  40.37 
 
 
280 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3409  YdjC-like protein  39.77 
 
 
275 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2069  phospho-beta-glucosidase, YdjC- like protein, cellobiose degradation  37.09 
 
 
265 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358232  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1054  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  36.97 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1051  YdjC family protein  38.52 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1837  YdjC family protein  40.68 
 
 
267 aa  168  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4284  YdjC-like protein  38.15 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0693  YdjC-like protein  37.78 
 
 
294 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1172  YdjC family protein  37.78 
 
 
294 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1148  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.78 
 
 
294 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  0.486153 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1778  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  39.86 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2119  hypothetical protein  39.86 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2194  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  37.63 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2132  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.95 
 
 
294 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1768  YdjC-like family protein  38.64 
 
 
295 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1178  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  38.87 
 
 
283 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0576  YdjC-like family protein  37.88 
 
 
295 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2858  YdjC-like family protein  37.88 
 
 
289 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2851  YdjC-like family protein  37.88 
 
 
295 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2736  YdjC family protein  38.26 
 
 
295 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2795  YdjC family protein  37.88 
 
 
295 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1751  YdjC family protein  37.88 
 
 
295 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1293  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.06 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214385  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20670  hypothetical protein  39.08 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4902  hypothetical protein  36.9 
 
 
251 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7155  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.36 
 
 
284 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6340  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  35.21 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3655  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  34.32 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.507009  normal  0.0806723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3456  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  33.57 
 
 
280 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0306936  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0972  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  36.98 
 
 
280 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3765  hopanoid biosynthesis associated protein HpnK  34.69 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3115  YdjC family protein  29.63 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00112169  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0263  YdjC family protein  29.68 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2136  YdjC family protein  30.18 
 
 
245 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002439  cellobiose phosphotransferase system YdjC-like protein  29.69 
 
 
251 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.79418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03621  hypothetical protein  35.76 
 
 
251 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2271  hypothetical protein  31.71 
 
 
247 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.139095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0904  hypothetical protein  38.82 
 
 
252 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4030  YdjC-like protein  28.09 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.41165  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3750  hypothetical protein  30.97 
 
 
235 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1261  YdjC family protein  28.52 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25731  hypothetical protein  29.72 
 
 
435 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5055  hypothetical protein  29.24 
 
 
234 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5440  hypothetical protein  29.24 
 
 
234 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2008  YdjC family protein  28.88 
 
 
261 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000350011  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4402  YdjC family protein  28.08 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.399507  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2959  YdjC family protein  33.7 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4900  hypothetical protein  29.24 
 
 
234 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5372  hypothetical protein  32.12 
 
 
234 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5317  hypothetical protein  28.88 
 
 
234 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5000  hypothetical protein  27.94 
 
 
234 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4885  hypothetical protein  28.88 
 
 
234 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5296  hypothetical protein  28.88 
 
 
234 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000474438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5632  hypothetical protein  29.96 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000570656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5327  hypothetical protein  29.35 
 
 
235 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0046  YdjC family protein  29.79 
 
 
307 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1815  hypothetical protein  26.92 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1899  hypothetical protein  26.92 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.238209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1431  hypothetical protein  28.73 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1414  hypothetical protein  28.73 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.0189616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1854  hypothetical protein  28.73 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.471908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2027  hypothetical protein  28.73 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.747309  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1909  YdjC family protein  26.92 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.24977  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1446  hypothetical protein  28.73 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1458  hypothetical protein  27.02 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890936  normal  0.315739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01702  hypothetical protein  26.92 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.74852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01690  hypothetical protein  26.92 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.751954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05280  cellobiose-phosphate cleavage protein, YdjC family  34.72 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0599577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1095  hypothetical protein  26.06 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1954  hypothetical protein  27.02 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3572  hypothetical protein  26.06 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000340132  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1148  hypothetical protein  26.06 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00261143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0838  hypothetical protein  26.3 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.436002  hitchhiker  0.00113451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1711  hypothetical protein  25.43 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5852  hypothetical protein  28.33 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143064  normal  0.707413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2451  hypothetical protein  27.02 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.410079  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3342  YdjC family protein  24.37 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0193  hypothetical protein  28.51 
 
 
412 aa  72.4  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1501  hypothetical protein  28.91 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.420206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0422  YdjC family protein  25.18 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  0.0884188 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0163  hypothetical protein  28.57 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2484  YdjC family protein  28.05 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1536  YdjC family protein  29.01 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.700585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3150  YdjC family protein  27.63 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4311  YdjC family protein  28.66 
 
 
349 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.279208  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1482  hypothetical protein  26.14 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.929836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0695  hypothetical protein  26.14 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0263511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4675  YdjC family protein  32.17 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1624  YdjC-like protein  29.7 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2373  YdjC family protein  21.25 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2010  YdjC-like protein  29.11 
 
 
242 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>